在抗“非典”期间,市工商联(总商会)及时调整工作重点,确定5、6月份为工商联调研月,开展民营经济发展环境专题调研。同时针对因非典影响损失较大的行业存在的困难和问题,及时组织专题调研活动。调研报告《我市部分餐饮、旅游行业民营企业非典时期经营及应对情况调查》上报市政协后被转报市委、市政府,报告提出的政策性建议转化为市政府出台的应对非典影响的扶持政策。在抗击非典期间,全市各级工商联组织、团结和引导广大民营企业,承担起中国特色社会主义事业建设者的社会责任。市工商联(总商会)组织10位代表人士联名向全市民营企业发出“抗击非典、真情奉献”的倡议,并捐赠8万元款物,得到了更多民营企业的积极响应。据不完全统计,抗非期间,全市工商联会员企业捐赠款物达109.8万元。在市工商联(总商会)十届二次常委会上,市工商联(总商会)和市委统战部对连云港市太阳雨热水器制造有限公司等17个会员企业授予“支持抗非斗争先进会员企业”称号,对光明集团连云港分公司等16个会员企业给予通报表扬。市工商联(总商会)美容美发业商会会长企业等6家会员企业因在抗非工作中表现突出,作为“支持抗非斗争有功单位”受到市委、市政府的表彰。
2003年6月,康缘药业股份有限公司等6家非公有制企业和行业商会获得市委、市政府“抗非斗争有功单位”的表彰。